原住民族課程發展協作中心組織架構建構出「東區中心」的運作任務如下：

一、建立原住民族課程發展協作平台，提供課程發展模組，協助原住民族實驗學 校、原住民重點學校、及原住民族實驗教育班，發展以原住民族文化本位的課程。

1. 針對原住民族實驗學校：

（1）協助原住民族實驗學校課程發展，同時檢視及統整各實驗學校的課程發展模式。

（2）評估原住民族實驗學校課程可能的發展方向。

2. 針對原住民族重點學校：

（1）輔導學校發展以原住民族教育為特色的學校本位課程。

（2）輔導學校發展文化回應式課程。

3. 針對原住民族實驗教育班：

（1）輔導學校針對實驗教育班發展以原住民族教育為特色的課程。

（2）輔導建立課程評鑑及回饋機制，確保課程品質。

二、協助原住民族實驗學校、原住民族重點學校及原住民族實驗班發展更具成效的族語教學模式。

三、建構課程教學研發及教師專業支持系統，增進教師專業知能。

四、建置原住民族教學資源與媒材。

五、發展原住民族課程評鑑及回饋機制，確保課程品質。

六、建置原住民族課程發展諮詢委員資料庫。